|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ФИЦ ПХФ и МХ РАН |
||
Разработка метода анализа высококопийных геномных повторовдипломная работа (Специалист)
- Научный руководитель: Боков Г.В.
- Автор: Устькачкинцева Татьяна Викторовна
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2024
- Аннотация: Основная часть геномных исследований сфокусирована на уникальных участках генома для изучения связи молекулярно-биологических особенностей с фенотипическими проявлениями, эволюционными факторами и историческими процессами. Однако более 50% генома состоит из повторяющихся последовательностей, недоизученных в частности ввиду того, что большинство геномов из открытых баз данных секвенированы короткими прочтениями, что делает невозможной сборку этих регионов. В работе разработан метод анализа альфа-сателлитных последовательностей ДНК, состоящих из высокоорганизованных массивов высококопийных последовательностей в центромерных и перицентромерных регионах. В результате был получен алгоритм составления индивидуального профиля центромер человека на основании альфа-сателлитных последовательностей генома человека и изучена его устойчивость при использовании полногеномного секвенирования разного покрытия и длины прочтений. Также показано, что существует чувствительность индивидуальных альфоидных профилей людей, относящихся к одной метапопуляции/популяции. Применение алгоритма на реальных данных показало возможность его усовершенствования для решения других биологических задач в области криминалистики, архе-палеогенетики и медицины.
- Добавил в систему: Боков Григорий Владимирович