|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ФИЦ ПХФ и МХ РАН |
||
Проблема экологической целостности таксонов дрожжевых грибов в связи с сезонной динамикой сообществНИР
The problem of ecological integrity of yeasts taxons in relations with seasonal dynamic of communities
- Руководитель НИР: Чернов И.Ю.
- Ответственные исполнители: Глушакова А.М., Качалкин А.В., Максимова И.А.
- Подразделение: Лаборатория почвенной микробиологии
- Срок исполнения: 1 января 2010 г. - 31 декабря 2012 г.
- Номер договора (контракта, соглашения): 10-04-00332-а
- Номер ЦИТИС: 01201161888
- Тип: Фундаментальная
- Приоритетное направление научных исследований: Почва и почвенный покров России как основа её устойчивого развития.
-
Ключевые слова:
дрожжи, сезонная динамика, проблема вида, эпифиты, почвенные микроорганизмы
species concept problem, seasonal dynamics, soil microorganisms, epiphytes, yeast -
Описание:
Настоящий проект посвящен анализу изменений дрожжевых сообществ, происходящих в течение года в связи с сезонной динамикой гидротермических условий и в ходе сукцессий при разложении растительных остатков. Планируется провести детальные исследования сезонных изменений численности и видовой структуры дрожжевых сообществ, формирующихся на листьях растений, в разлагающихся растительных остатках и в почве. При этом видовая идентификация дрожжей будет проводиться с учетом новейших таксономический перестроек в систематике дрожжей, прежде всего связанных с «дроблением» крупных изменчивых видов на более мелкие виды на основе молекулярно-генетических критериев. Основная цель проекта – выявить тот уровень и такой подход к таксономической дифференциации дрожжевых грибов, при котором наблюдается максимальная зависимость операциональных таксономических единиц от экологических факторов. Основная рабочая гипотеза состоит в том, что при отсутствии строгих биологических критериев видовых различий у агамных видов, в качестве видового имеет смысл выбирать тот уровень дифференциации, на котором наблюдается максимальная экологическая индивидуальность выделяемых единиц. При этом в качестве одного из проявлений экологической индивидуальности вида рассматривается особый характер сезонной динамики. Кроме этого, планируемое круглогодичное исследование динамики дрожжевых сообществ преследует и другие цели, связанные с получением более детальных сведений об экологии этой группы грибов. До настоящего времени отсутствуют данные о характере сезонной динамики дрожжей в энтомофильных цветках, где их обилие наиболее велико из-за высокой концентрации простых сахаров в нектаре. Кроме того, не известно, какие сезонные изменения происходят с автохтонными педобионтными дрожжами в почвах, которые представлены как аскомицетовыми, так и базидиомицетовыми видами. Знание особенностей динамики дрожжевых сообществ в природных субстратах полезно и в прикладных аспектах, в частности для разработки методов биоконтроля фитопатогенов, в котором дрожжи все чаще используются в последние годы, а также для более эффективного скрининга дрожжевых штаммов, представляющих ценность для биотехнологии.
- Добавил в систему: Качалкин Алексей Владимирович
Источник финансирования НИР
| грант РФФИ |
Этапы НИР
| # | Сроки | Название |
| 1 | 1 января 2010 г.-31 декабря 2010 г. | этап 2010 |
| Результаты этапа: По результатам многолетних мониторинговых исследований на территории Москвы и Московской области составлен аннотированный список видов дрожжевых грибов в соответствии с последними изменениями в систематике дрожжей. Всего в различных природных субстратах, включающих в основном почвы, растительные остатки и различные части растений, а также сахаристые локусные субстраты, такие как сочные плоды, цветочный нектар и т.п. обнаружено 160 видов дрожжей. | ||
| 2 | 1 января 2011 г.-31 декабря 2011 г. | этап 2011 |
| Результаты этапа: Проведенные исследования были направлены в основном на ревизию сформировавшихся представлений о видовой принадлежности доминирующих видов дрожжей на основе круглогодичных мониторинговых анализов различных почвенных и растительных субстратов и молекулярно-генетической идентификации видов. По результатам круглогодичных анализов нескольких сотен образцов почв и растительных субстратов в Московском регионе доминантами среди дрожжевых грибов филлосферы являются виды Rhodotorula mucilaginosa, Cryptococcus magnus, цветков – Metschnikowia reukaufii, Hanseniaspora uvarum, подстилки – Cystofilobasidium capitatum, Trichosporon porosum, почвы – Cryptococcus podzolicus, Cryptococcus terreus, Cryptococcus terricola. Таким образом, для некоторых доминантов, благодаря молекулярным методам, удалось скорректировались видовые названия по сравнению с более ранними исследованиями: Rhodotorula glutinis ? Rhodotorula mucilaginosa, Cryptococcus albidus ? Cryptococcus magnus, Hanseniaspora guilliermondii ? Hanseniaspora uvarum. Некоторые названия остались без изменений: Metschnikowia reukaufii, Cystofilobasidium capitatum, Cryptococcus podzolicus, Cryptococcus terricola. Однако выявленные изменения названий видов с учетом молекулярных признаков относятся к тем достаточно филогенетически компактным кладам, к которым принадлежали и ранее «неверно» идентифицировавшиеся виды. | ||
| 3 | 1 января 2012 г.-31 декабря 2012 г. | этап 2012 |
| Результаты этапа: В современной систематике микроорганизмов, базирующейся в основном на молекулярно-биологических критериях, сложилась ситуация, при которой самостоятельные бинарные видовые названия часто присваиваются любой, даже однократно встреченной нуклеотидной последовательности определенного региона рДНК в том случае, если она отличается от известных более, чем на некую условную величину. Это привело к накоплению большого количества видов, описание которых основано на изучении единичных штаммов, которые выделены однократно, причем повторные их выделения очень маловероятны. Негативной стороной стала девальвация сформировавшегося в общей биологии понятия вида, как сложной иерархически организованной системы, обладающей экологической индивидуальностью, существующей в определенной экологической нише. Проведенные нами за отчетный период исследования были направлены в основном на ревизию сформировавшихся представлений о видовой принадлежности доминирующих видов дрожжей на основе круглогодичных анализов дрожжевого населения филлосферы, опада и верхних горизонтов почв Московской области, в основном на примере национального парка Лосиный остров. Идунтификацию выделенных культур проводили на основании секвенирования D1D2 домена 26S рДНК. Полученные данные позволили скорректировать представления о видовой структуре природных дрожжевых сообществ. | ||
Прикрепленные к НИР результаты
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".