![]() |
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ФИЦ ПХФ и МХ РАН |
||
Фундаментальная научная проблема, на решение которой направлен проект, - это исследование процессов и закономерностей формирования таксономического разнообразия, а именно выяснение основ взаимодействия молекулярно-генетической и морфо-экологической изменчивости в процессе видообразования, в том числе, факторов, определяющих широкое распространение криптических видов среди тропических амфибий и рептилий. Эта проблема обусловила основную цель нашего проекта, которая заключается в разработке методологии объективной оценки таксономического ранга видовых и околовидовых форм на примере различных групп земноводных (Amphibia) и пресмыкающихся (Reptilia), населяющих Юго-Восточную Азию.
Studies of the processes which shape the dynamics of biodiversity, biodiversity assessment and elaboration of conservation measures form one of the most important fields in general biology. Such studies have both high theoretical value for understanding the general patterns of evolutionary processes, and also very high practical value for estimating the perspectives of future development of biodiversity. Tropical ecosystems host the major part of the biodiversity of the planet (Myers et al., 2000); the intensive shrinkage of areas covered with tropical rainforests represent one of the biggest threats to the biodiversity causing its extinction even before it is discovered by scientists. This “biodiversity crisis” as well as the practical lack of knowledge of its actual scale, together with the intensive reduction of natural habitats, requires a broad study of the of species richness and endemism distribution patterns throughout the planet (Koh et al., 2004). In the present project we for the first time will use an integrative approach to analysis of cryptic diversity in Southeast Asian herpetofauna, based on species delimitation and biodiversity assessment from multilocus phylogenetic analyses of mtDNA and nuDNA markers, morphological, karyotype, behavioral and ecological data. The results of such analysis will help to create working protocols for species delimitation which will serve as a basis for further biodiversity assessments and elaboration of the respective conservation measures. The study is based on a unique tissue collection of Southeast Asian amphibians and reptiles created by the research team during the last 12 years of fieldwork and presently comprising over 10000 samples. We plan to examine phylogenetic relationships and elaborate species delimitation working protocols for several model groups of Southeast Asian amphibians and reptiles, including caecilians (family Ichthyophiidae), tailless amphibians (families Megophryidae, Bufonidae, Ranidae, Rhacophoridae, and Microhylidae), lizards (families Gekkonidae, Dibamidae, Scincidae, and Anguidae) and snakes (families Pareidae, Natricidae, Colubridae, and Viperidae). For most of the model groups in question an integrative analysis of their phylogenetic relationships and species diversity will be carried out for the first time. The special focus will be on the study of changes in diversification rate in the most diverse radiations of large genera of Southeast Asian amphibians and reptiles (such as frogs Megophrys sensu lato, Odorrana, Amolops, Microhyla, geckoes Cyrtodactylus and Cnemaspis, skinks Scincella and Sphenomorphus, snakes Oligodon and Trimeresurus). We plan to analyze the environmental and historical factors which could lead to the extreme diversity observed in these groups and to estimate the role of cryptic speciation in their evolution. For the first time we will provide an integrative analysis of cryptic species contribution to biodiversity of Southeast Asian herpetofauna. Based on the results of phylogenetic analyses, we will revise taxonomy of the groups under study, propose necessary taxonomic changes and describe a number of new species. Based on the data of integrative analysis of Southeast Asian herpetofaunal diversity we will analyze its biogeographic structuring, define hotspots of endemism and diversity, what is urgently needed for planning of further studies and conservation measures.
По итогам выполнения проекта нами будут получены следующие основные результаты: 1) На обширном оригинальном материале будет проанализировано криптическое разнообразие червяг рода Ichthyophis (семейство Ichthyophiidae) фауны Индокитая; будет проанализирована дифференциация комплекса I. bannanicus, будут подготовлены описания новых таксонов, проанализировано распространение и биогеография группы. 2) Впервые по комплексным данным мтДНК. яДНК, морфологии и акустики будет детально исследовано разнообращие и филогенетические связи азиатских чесночниц семейства Megophryidae, населяющих Гималаи, Восточную Азию, Индокитай, Зондскую сушу и Филиппины. В рамках концепции интегративной систематики будут проведены ревизии ряда групп родов Leptobrachella, Leptobrachium, Xenophrys и Ophryophryne, пересмотрена система семейства, описаны ряд новых для науки видов. 3) Впервые на обширном оригинальном материале будут проанализированы филогенетические связи и криптическое разнообразие жаб рода Ingerophrynus (Bufonidae), населяющих Восточный и Западный Индокитай, о-в Хайнань, Зондский архипелаг и Филиппины. Будет проанализирована дифференциация комплексов криптических видов I. galeatus, I. parvus, I. macrotis, подготовлены ревизии и описан ряд новых видов. Впервые по интегративным данным (мтДНК + яДНК) будет исследована криптическая радиация широкоареального комплекса Duttaphrynus melanostictus со всего ареала. 4) С помощью комплексного молекулярно-генетического и морфологического анализа будут проведены исследования криптического разнообразия нескольких групп настоящих лягушек Юго-Восточной Азии (семейство Ranidae) – реофильных родов Odorrana и Amolops, населяющих горные ручьи, а также равнинных Hylarana, размножающихся в стоячих водоемах. Будет оценен вклад экологической специализации в формирование криптического разнорбразия в этих группах. Будет уточнен таксономический статус многих форм и описано несколько новых для науки таксонов. 5) Будут осуществлены молекулярно-генетические, морфологические и акустические исследования таксономически проблемных видовых комплексов ряда родов веслоногих лягушек Юго-Восточной Азии (семейство Rhacophoridae). Будет исследована дифференциация и криптическое разнообразие в родах Rhacophorus, Zhangixalus, Kurixalus, Gracixalus и Chiromantis. Будут подготовлены таксономические ревизии и описан ряд новых для науки видов. 6) Впервые на обширном материале будут осуществлены масштабные исследования филогенетических связей, видового разнообразия, и биогеографии узкоротых лягушек семейства Microhylidae фауны Юго-Восточной Азии. При оценке таксономического статуса выявленных форм будут учитываться данные мтДНК и яДНК маркеров, внешней и скелетной морфологии, а также акустической коммуникации. Будет проведен анализ дифференциации рода Microhyla мировой фауны, проведена ревизия, оценен таксономический статус линий в составе рода Microhyla, выявлены и описаны ряд новых видов. Впервые будет проведена комплексная ревизия рода Micryletta, проанализирована его биогеография, выяснен таксономический статус составляющих его линий и описан ряд новых для науки видов. Впервые будет проанализирована филогения и филогеография видов рода Kaloula фауны Индокитая, выявлены и описаны ряд новых видов Kaloula. Будут проведены исследования таксономического разнообразия подсемейства Asterophryinae (Microhylidae) континентальной Юго-Восточной Азии (роды Siamophryne, Vietnamophryne и Gastrophrynoides). 7) Впервые будет проведен анализ молекулярной дифференциации и разнообразия слепосцинков (семейство Dibamidae) - примитивной группы роющих безногих представителей Squamata. Будет предложена наиболее полная филогения рода Dibamus фауны Юго-Восточной Азии, оценен таксономический статус выявленных линий, проведена ревизия группы. 8) Молекулярно-генетические методы будут применены для оценки разнообразия ряда групп гекконовых ящериц Юго-Восточной Азии (Gekkonidae), прежде всего родов Cyrtodactylus и Cnemaspis. Будет осущестлена инвентаризация криптического разнообразия и биогеографии Cyrtodactylus и Cnemaspis мировой фауны с помощью ДНК-баркодинга и исследования независимых генетических маркеров. Будут подготовлены описания ряда новых видов гекконов Юго-Восточной Азии. 9) На обширном оригинальном материале будет осуществлено масштабное исследование разнообразия сцинковых ящериц Юго-Восточной Азии (семейство Scincidae). В качестве модельных групп будут исследованы видовые комплексы родов Lipinia, Lygosoma, Sphenomorphus и Scincella фауны Индокитая. С помощью комплексного молекулярно-генетического и морфологического подхода будет оценено их криптическое разнообразие, выявлены формы видового ранга, осуществлены таксономические ревизии и описан ряд новых видов. 10) Впервые будет предпринято молекулярно-генетическое исследование разнообразия веретенницевых ящериц (семейство Anguidae) фауны Юго-Восточной Азии. Будет изучена дифференциация рода Dopasia, что может привести к пересмотру видовых границ и описанию ряда новых таксонов. Также будет исследована биогеогарфия группы. 11) Впервые будет исследована филогения, биогеография, разнообразие и таксономия змей-улиткоедов рода Pareas (семейство Pareidae), фауны Юго-Восточной Азии. Будет проведена комплексная молекулярно-генетическая и морфологическая ревизия группы и описаны новые для науки виды. 12) Будут получены первые данные по молекулярно-генетической дифференциации ужеобразных змей Юго-Восточной Азии (семейство Natricidae). Будет исследована филогения Индокитайских представителей родов Hebius, Sinonatrix, Xenochrophis, Amphiesmoides, Opisthotropis. Имеющиеся данные по морфологической дифференциации видов будут сопоставлены с молекулярно-генетическими данными. 13) Будут проведены масштабные исследования разнообразия и филогении змей семейства Colubridae фауны Юго-Восточной Азии. Впервые будет оценено криптическое разнообразие и исследована молекулярная систематика змей рода Oligodon в масштабе мировой фауны. Будет исследована молекулярно-генетическая и морфологическая дифференциация волкозубов рода Lycodon (включая Dinodon). Впервые будет исследовано разнообразие змей рода Liopeltis фауны Индокитая. Впервые будет изучена филогеография широкоареального и изменчивого вида Oreocryptophis porphyraceus. Будут описаны новые таксоны. 14) Будет исследована молекулярно-генетическая дифференциация и криптическое разнообразие куфий рода Trimeresurus (Viperidae) фауны Индокитая, широко распространенной и крайне сложной в таксономическом отношении группы. Будет соспоставлена морфологическая и генетическая изменчивость комплексов T. stejnegeri, T. macrops и ряда других, а также, вероятно, описан ряд новых форм.
За последние пять лет получены новые уникальные данные по истории и механизмам формирования биоразнообразия герпетофауны Восточной, Юго-Восточной и Центральной Евразии, представленные в серии научных статей в рецензируемых международных журналах. За этот период опубликовано 122 публикации, из них 74 - статьи в международных рецензируемых изданиях, 2 монографии и 46 тезисов конференций. Собрана уникальная коллекция проб тканей земноводных и пресмыкающихся Евразии, насчитывающая более 12000 экземпляров. В ходе работы за последние пять лет открыты и описаны 69 новых для науки таксонов амфибий и рептилий, включая множество новых видов, два новых для науки рода лягушек из Индокитая и один новый для науки род змей из Ирана. Полученные данные в корне меняют представление о разнообразии, биогеографии и путях формирования герпетофауны Юго-Восточной и Центральной Азии. Показана ведущая роль Индокитая как ключевой территории для формирования автохтонного разнообразия, путей расселения герпетофауны и обмена фаунами с Восточной Азией, Австралазией и Индийским субконинентом. Показаны неоднократные процессы фаунистического обмена между Восточной Азией, Северной Америкой и Европой, определившие рецентную структуру герпетофауны северной Евразии. Показана определяющая роль кайнозойских климатических колебаний в определении дифференциации пустынных групп рептилий Центральной и Средней Азии. Получены новые оценки криптического разнообразия различных групп амфибий и рептилий Юго-Восточной, Восточной и Центральной Азии. Научные результаты представлены на 5 международных конференциях, включая Всемирный герпетологический конгресс и Конгресс Европейского герпетологического общества, где был представлен приглашенный пленарный доклад. Осуществляется руководство над тремя диссертационными работами аспирантов, одной бакалаврской и четырьмя магистерскими диссертациями.
Для исследуемых групп амфибий и рептилий будет проведен оценка времен дивергенции с помощью методов молекулярных датировок, а затем будет осуществлен анализ изменения скорости кладогенеза в ходе их дифференциации. Будут выявлены клады, характеризующиеся повышенной или пониженной скоростью кладогенеза, а также проведен анализ морфо-экологических (таких как адаптация к специфическим типам местообитаний, особенности репродуктивной биологии и развития, миниатюризация, и так далее) и биогеографических (как, например, колонизация новых регионов) факторов, которые могли определить эволюционный успех наиболее разнообразных групп азиатских амфибий и рептилий. Отдельное внимание будет уделено интегративному анализу радиаций широкоареальных видовых комплексов земноводных, область распространения которых охватывает почти всю территорию Юго-Восточной Азии (представители родов Duttaphrynus, Microhyla, Ichthyophis и других). Помимо традиционного исследования маркеров мтДНК и морфологии, генетическая структура ряда модельных видовых комплексов амфибий будет изучена с применением методов секвенирования нового поколения (RAD-seq). Эти данные позволят впервые получить целостное представление о наличии репродуктивных барьеров между линиями и потоке генов между ними, что позволит получить более объективную оценку криптического разнообразия в этих группах. Планируемые нами конкретные научные результаты по дифференциации модельных групп земноводных и пресмыкающихся Юго-Восточной Азии приведут к пересмотру представлений об их разнообразии и описанию целого ряда новых для науки таксонов, что имеет кардинальное значение для разработки адекватных природоохранных мер. Тропические леса Юго-Восточной Азии подвергаются наиболее масштабным угрозам со стороны антропогенных факторов из всех прочих регионов мира (Sodhi et al., 2004). Оценка и разработка мер охраны биоразнообразия этого региона является одним из важнейших вызовов, стоящих перед научным и природоохранным сообществом. Учитывая исторически значительный вклад отечественной герпетологии в изучение герпетофауны Юго-Восточной Азии, степень квалификации и имеющийся научный задел российских специалистов создают неоспоримое преимущество в этой области зоологических исследований. Широкий масштаб планируемых нами работ позволит закрепить лидирующие позиции отечественных специалистов в этом направлении. По итогам работы будет опубликовано не менее 30 научных работ, включая не менее 20 статей в журналах WoS.
грант РНФ |
# | Сроки | Название |
1 | 13 мая 2022 г.-31 декабря 2022 г. | Факторы и динамика формирования криптического разнообразия фауны земноводных и пресмыкающихся Юго-Восточной Азии: сбор и обработка данных, подготовка публикаций |
Результаты этапа: В 2022 отчетном году весь заявленный годовой план работы полностью выполнен. Основной упор в ходе работы нашей группы в 2022 году был сделан на проведение полевой экспедиционной работы, проведение молекулярно-генетических экспериментов, обработку полученных данных и подготовку публикаций по проекту. Не смотря на сложности с организацией полевой работы, пять участников проекта приняли участие в экспедициях и смогли собрать обширный новый материал. Аспирантом В.А. Гориным (основным исполнителем проекта) успешно защищена диссертация на соискание степени кандидата биологических наук на тему «Филогения, систематика и историческая биогеография узкоротов подсемейства Microhylinae (Amphibia: Anura: Microhylidae)». В общей сложности за отчетный год по проекту опубликовано 4 научных публикации, из них – 3 статьи в рецензируемых журналах (из которых 1 статья опубликована в журнале первой квартили Q1, две статьи – в журналах Q2), и 1 – тезисы конференции. В этом отношении план по публикациям за 2022 год можно считать перевыполненным. Также по результатам работы в первый год проекта еще 10 статей поданы в журналы первой и второй квартили, из них четыре находятся на стадии второго круга рецензирования, а 6 – на стадии первой рецензии. Ниже рассмотрим фактическое выполнение годового плана работы по каждому из направлений исследований. А. Экспедиционная работа В связи со сложностью командирования сотрудников МГУ зарубеж в период пандемии, экспедиции 2022 года лишь частично оплачивались за счет средств фонда РНФ (сроком не более 40 дней); ряд экспедиций были оплачены из иных источников финонсирования, однако проводимые в ходе этой работы исследования, включая сбор материала, осуществлялись для выполнения целей нашего проекта. В 2022 году члены коллектива проекта приняли участие в следующих экспедициях. 1) Вьетнам: Н.А. Поярков (с апреля 2022 г по июль 2022 г, 11 недель), и П.В. Ющенко (с июня 2022 по август 2022, 12 недель). Получены уникальные данные по герпетофауне провинций Хазянг (заповедник Батдайшон), Квангнам (охраняемый лес Тэйзянг), Квангбинь (н.п. Фоння-Кебанг), Хатинь (н.п. Вукуанг), Тханьхоа (заповедник Суанльен), Зялай (заповедник Контюранг), Ламдонг (н.п. Бидуп-Нуйба, лес Зилинь), Донгнай (н.п. Каттьен), Лаокай (заповедник Батсат) и Йенбай (заповедник Мукангчай). 2) Таиланд: Н.А. Поярков (с августа 2022 г по сентябрь 2022 г, 4 недели). Собраны обширные материалы по герпетофауне провинций Пхукет, Яла, Сатун, Транг, Краби, Прачуап-кхири-кхан, Ратчабури, Канчанабури, Накхон-Найок, Наратхиват, Накхон-Сри-Тхаммарат. 3) Таиланд: С.Ш. Идиятуллина (с июля 2022 по август 2022, 4 недели). Проведена работа с музейными коллекциями и коллекцией живых экземпляров змеиной фермы Мемориального института королевы Саовабхи, г. Бангкок. Также проведена экспедиционная работа и собран материал по герпетофауне провинций Чантабури, Накхон-Найок, Бангкок. 4) Индонезия: А.М. Брагин (с июня 2022 по август 2022, 12 недель): обследованы различные природохранные территории островов Бали, Ломбок, Нуса-Пенида, Суматра, Сиберут, собрана обширная коллекция экземпляров и проб тканей. 5) Индонезия: Н.С. Клюкин (сентябрь 2022, 3 недели): обследованы тропические леса острова Ниас, собрана обширная коллекция экземпляров и проб тканей. 6) Камбоджа: Н.С. Клюкин (август 2022, 2 недели): обследованы тропические леса провинции Кампот, собрана коллекция экземпляров и проб тканей. 7) Индия: А.М. Брагин (с октября 2022 по ноябрь 2022, 4 недели): обследованы различные природохранные территории штата Мизорам, Северо-Восточная Индия, собрана обширная коллекция экземпляров и проб тканей (депонирована в Мизорамском университете). В результате экспедиций исследовано таксономическое разнообразие и структурная организация сообществ земноводных и пресмыкающихся различных типов тропических лесов Таиланда, Камбоджи, Индонезии и Вьетнама, собран богатый материал: около 2517 экземпляров по примерно 250 видам земноводных и 300 видам пресмыкающихся. Полный список собранных материалов приведен в Приложении (данные обобщены в Таблице 1, см. Дополнительные материалы). По предварительным данным, в проведенных сборах выявлен ряд новых для науки видов амфибий и рептилий, описания которых готовятся к печати. Полученные данные существенно расширяют имеющиеся представления о разнообразии и распространении амфибий и рептилий Таиланда и Вьетнама. В. Лабораторная работа В проведении молекулярно-генетических экспериментов в 2022 году были задействованы следующие участники проекта: Поярков Н.А., Соловьева Е.Н., Горин В.А., Ющенко П.В., Брагин А.М., Идиятуллина С.Ш., Клюкин Н.С., и Трофимец А.В. В целом лабораторная обработка материала полностью завершена: за 2022 год ДНК выделена из ок. 1518 проб различных групп земноводных и пресмыкающихся, осуществлено более 3712 ПЦР-реакций и получены последовательности для ок. 3114 фрагментов индивидуальных генов (данные обобщены в Таблице 2, см. Дополнительные материалы). При участии всех участников проекта осуществлена первичная статистическая и филогенетическая обработка данных (результаты по отдельным группам представлены ниже). С. Участие в конференциях В 2022 году в связи со сложной эпидемиологической обстановкой, нами было принято решение отказаться от запланированного ранее участия нашей группы в 22 конгрессе Европейского герпетологического общества (SHE-22), прошедшего в начале сентября в Белграде, Сербия. Члены нашего коллектива приняли участие в IIй Всероссийской конференции и Школе для молодых учёных памяти Феликса Яновича Дзержинского «Эволюционная и функциональная морфология позвоночных», прошедшей в начале октября на базе Звенигородской биологической станции МГУ. В.А. Горин представил доклад на тему «Экологические адаптации в строении скелета у лягушек подсемейства Microhylinae (Amphibia: Microhylidae)», материалы доклада опубликованы в сборнике материалов конференции. Кроме этого, А.М. Брагин и П.В. Ющенко представили два устных доклада на 4м Научном конгрессе штата Мизорам, Индия (4th Mizoram Science Congress, 24-25 ноября 2022 г). D. Подготовка полученных материалов к публикации В общей сложности за отчетный год по проекту опубликовано 5 научных публикации, из них – 3 статьи в рецензируемых журналах (из которых 1 статья опубликована в журнале первой квартили Q1) уже опубликованы, одна статья принята в печать, также опубликованы одни материалы конференции. Остальные полученные в ходе выполнения проекта результаты обработаны и поданы в печать и в настоящее время находятся на рецензии, или подготовлены к подаче в печать. В частности, 4 чтатьи проходят второй раунд рецензирования, и еще 4 статьи проходят первый раунд рецензирования. | ||
2 | 1 января 2023 г.-31 декабря 2023 г. | Факторы и динамика формирования криптического разнообразия фауны земноводных и пресмыкающихся Юго-Восточной Азии: сбор и обработка данных, подготовка публикаций |
Результаты этапа: В 2023 отчетном году весь заявленный годовой план работы полностью выполнен. Основной упор в ходе работы в 2023 году был сделан на проведение экспедиционной работы, молекулярно-генетических экспериментов, обработку полученных данных и подготовку публикаций по проекту. В общей сложности, 7 участников проекта приняли участие в экспедициях во Вьетнам, Таиланд и Малайзию и смогли собрать обширный новый материал (2336 экземпляров и проб тканей различных групп земноводных и пресмыкающихся). В общей сложности за отчетный год по проекту опубликовано 20 научных публикаций, из них – 20 статьи в рецензируемых журналах (из которых 12 статей опубликовано в международных журналах первой квартили Q1, а одна статья – в отечественном журнале, входящим во вторую квартиль Q2). В этом отношении план по публикациям за 2023 год перевыполнен. По результатам работы за второй год проекта еще 10 статей поданы в печать. Ниже рассмотрим фактическое выполнение годового плана работы по каждому из направлений исследований. А. Экспедиционная работа Экспедиции 2023 года лишь частично были оплачены за счет средств фонда РНФ; ряд экспедиций были оплачены из иных источников финансирования, однако проводимые в ходе этой работы исследования, включая сбор материала, осуществлялись для выполнения целей нашего проекта. В 2023 году члены коллектива проекта приняли участие в следующих экспедициях. 1) Вьетнам: Н.А. Поярков (с апреля 2023 г по июль 2023 г, 11 недель), А.М. Брагин (с июня 2023 по август 2023, 12 недель), В.А. Горин (в июне 2023 года, 2 недели). Полевые экспедиционные работы проведены в двенадцати природоохранных территориях южного, центрального и северного Вьетнама (провинции Лаокай, Йенбай, Хазянг, Зялай, Ламдонг, Донгнай, Ниньтхуан, Тхыатьен-Хюэ, Кханьхоа, Квангбинь, г. Дананг), в результате которых собран уникальный материал по примерно 142 видам земноводных и 126 видам пресмыкающихся, всего собрано около 2082 экземпляров и проб тканей. 2) Таиланд: С.Ш. Идиятуллина (с февраля 2023 г по март 2023 г, 4 недели). Собраны обширные материалы (137 экземпляров) по герпетофауне провинций Пхукет, Яла, Сатун, Транг, Краби, Прачуап-кхири-кхан, Ратчабури, и Канчанабури, Таиланд. 3) Малайзия: Н.С. Клюкин, А.В. Трофимец, Д.В. Архипов (с февраля 2023 г по март 2023 г, 4 недели). Экспедиционные работы проведены в султанатах Селангор, Келантан и Паханг. Собрано 117 экземпляров и генетических проб земноводных и пресмыкающихся. В результате экспедиций исследовано таксономическое разнообразие сообществ земноводных и пресмыкающихся тропических лесов Вьетнама, Таиланда и полуостровной Малайзии, собран богатый материал: около 2336 экземпляров по примерно 250 видам земноводных и 300 видам пресмыкающихся. Полный список собранных материалов приведен в Приложении (данные обобщены в Таблице 1, см. Дополнительные материалы). Собранные материалы депонированы в зоологических коллекциях Вьетнама (Совместный Российско-Вьетнамский Тропический Центр), Таиланда (Сельскохозяйственный университет Пхаяо) и Малайзии (Университет Пинанга), значительная часть экземпляров и все пробы тканей депонированы в коллекции Зоологического музея МГУ, Россия. В рамках работы с коллекциями ЗИН РАН двое участников гранта были командированы в г. Санкт-Петербург (Н.С. Клюкин, март 2023 года, 1 неделя; Н.А. Поярков, сентябрь 2023 года, 1 неделя). По предварительным данным, в проведенных сборах выявлен ряд новых для науки видов амфибий и рептилий (вероятно, около 43 видов), описания которых готовятся к печати. Полученные данные существенно расширяют имеющиеся представления о разнообразии и распространении амфибий и рептилий Юго-Восточной Азии. В. Лабораторная работа В проведении молекулярно-генетических экспериментов в 2023 году были задействованы следующие участники проекта: Поярков Н.А., Архипов Д.В., Горин В.А., Брагин А.М., Идиятуллина С.Ш., Клюкин Н.С., и Трофимец А.В. В целом лабораторная обработка материала полностью завершена: за 2023 год ДНК выделена из ок. 1969 проб различных групп земноводных и пресмыкающихся, осуществлено более 4763 ПЦР-реакций и получены последовательности для ок. 4552 фрагментов индивидуальных генов (данные обобщены в Таблице 2, см. Дополнительные материалы). При участии всех участников проекта осуществлена первичная статистическая и филогенетическая обработка данных (результаты по отдельным группам представлены ниже). С. Участие в конференциях В 2023 году результаты нашего проекта были представлены Н.А. Поярковым на конференции "Тропическая экология, охрана окружающей среды и рациональное использование ресурсов наземной и морской территорий Вьетнама. Научная конференция к празднованию 35-летия деятельности Российско-Вьетнамского тропического центра", проведенной в Ханое, Вьетнам. Более широкое представление результатов проекта на конференциях запланировано на 2024 год, когда состоится международный герпетологический конгресс (World Congress of Herpetology, август 2024 г.) и съезд герпетологического общества имени А.М. Никольского (октябрь 2024 г.). D. Подготовка полученных материалов к публикации В общей сложности за отчетный год по проекту опубликовано 20 научных публикаций, из них – 20 статьи в рецензируемых журналах (из которых 12 статей опубликовано в международных журналах первой квартили Q1, а одна статья – в отечественном журнале, входящим во вторую квартиль Q2). В этом отношении план по публикациям за 2023 год можно считать перевыполненным. Также по результатам работы во второй год проекта еще 10 статей поданы в печать. | ||
3 | 1 января 2024 г.-31 декабря 2024 г. | Факторы и динамика формирования криптического разнообразия фауны земноводных и пресмыкающихся Юго-Восточной Азии: сбор и обработка данных, подготовка публикаций, подготовка заключительного отчета по проекту |
Результаты этапа: В общей сложности, за отчетный этап 2024 года нашим коллективом в рамках выполнения проекта опубликовано 42 научных публикаций, из них 24 – статьи, опубликованные в международных журналах, из которых 6 статей опубликовано в журналах первой квартили Q1, а одна статья – в отечественном журнале, входящим во вторую квартиль Q2. Дополнительно, в ходе этапа 2024 года еще 10 статей поданы в печать в международные журналы, они находятся на стадии рецензирования. Результаты работы были представлены в 31 устном и 1 стендовом докладе на трех международных конференциях. За отчетный период нами описано 16 новых для науки таксонов амфибий и рептилий, в том числе один новый вид тритонов, четыре новых вида лягушек, четыре новых вида ящериц, и семь новых для науки вида змей; дополнительно один вид змей сведен в синонимы. Продолжено развитие концепции «филогеномной интегративной систематики», в журнале PNAS опубликован комментарий, расширяющий наши представления о подходах к разграничению видов и подвидов по филогеномным данным. В трех статьях завершающего этапа проекта нами впервые на практике применены сформулированные нами ранее подходы «филогеномной систематики» для уточнения классификации и разграничения видов у азиатских тритонов, жаб и узкоротых лягушек. В ходе выполнения третьего этапа проекта 2024 года нашей группой были получены следующие конкретные научные результаты по филогении, систематике, разнообразию, биогеографии и эволюции азиатских групп земноводных и пресмыкающихся. Общие результаты В ходе этапа 2023 года в журнале PNAS нами была предложена новая концепция разграничения видовых и подвидовых категорий в зоологической систематике. Наша публикация привлекла значительное внимание, за последний год она получила 43 цитирования по базе WoS. Завязалась оживленная дискуссия; мы опубликовали в журнале PNAS ответ, где указали, что наша схема хорошо согласуется с традиционными представлениями о политипическом виде, но подчеркнули, что принципиальная новизна филогеномных методов состоит в том, что они позволяют выявлять и интерпретировать структуру видов в гораздо более мелком масштабе, что обеспечивает более объективную классификацию разнообразия. По результатам исследования в журнале PNAS (Q1) опубликована статья: Dufresnes et al., 2024a. Проведен анализ разнообразия и эндемизма герпетофауны Юго-Восточной Азии, специализированной к жизни в известняковых карстовых массивах. Показано, что карстовые районы ЮВА выступают не только как «ковчеги» биоразнообразия, предоставляющие условия для сохранения реликтовых видов, но и как «лаборатории видообразования», то есть области усиленного кладогенеза в ряде групп. Карстовая герпетофауна ЮВА характеризуется высоким уровнем микроэндемизма. Исследование представлено в виде двух докладов на международных конференциях (Поярков, 2024; Poyarkov, 2024). Результаты по классу Amphibia Исследована систематика рода Ichthyophis Индокитая; в дополнение к полученным ранее генетическим данным проведен анализ 34 признаков внешней морфологии; выявлен новый вид рода Ichthyophis из Вьетнама; подготовлено его описание. Впервые исследована изменчивость краниологических признаков червяг рода Ichthyophis, с помощью микротомографии изучено строение черепов 20 экземпляров 8 видов, выявлены диагностические признаки; данные представлены в докладе на международной конференции (Скоринова и др., 2024). Впервые изучена изменчивость тритонов рода Tylototriton фауны северного Вьетнама по филогеномным, морфологическим и остеологическим данным; по данным анализа 2х генов мтДНК построено генеалогическое древо рода, также получено филогеномное дерево по данным анализа 3901 ddRAD-seq локусов яДНК. Из северного Вьетнама описан новый для науки вид T. koliaensis. Исследование является первым опытом применения филогеномных методов в систематике азиатских хвостатых амфибий. Статья опубликована в журнале Alytes (Q3): Poyarkov et al., 2024. Впервые представлено масштабное исследование геномной филогеографии и разграничения видов в видовом комплексе Duttaphrynus melanostictus по всему ареалу. Показано, что хотя анализ мтДНК выявляет в составе комплекса три линии предположительно видового ранга, одна из них представляет собой «призрачный таксон» и филогеномный анализ выявляет только две линии, каждая с заметной географической структурой. Наш анализ выявил генетическую идентичность популяций из Индии и острова Ява. Выдвинута гипотеза об опосредованном человеком расселении жаб из Индии в Индонезию на кораблях в исторический период. Исследование представлено в докладе на международной конференции (Dufresnes et al., 2024b), и опубликовано в журнале Nature Communications (Q1): Dufresnes et al., 2024c. Впервые изучена филогения и разнообразие жаб рода Ingerophrynus из 175 локалитетов по 3-м митохондриальным и 3-м ядерным генам. Филогенетический анализ выявил генетическую обособленность ряда популяций Ingerophrynus. Морфологический анализ представителей комплексов I. parvus и I. galeatus показывает наличие различий выявленных линий. Для 6 видов рода была исследована морфология черепа по данным микротомографии. Предварительные данные представлены в двух докладах на международных конференциях (Архипов и др., 2024; Arkhipov et al., 2024). Впервые проведено интегративное исследование систематики комплекса Microhyla berdmorei по филогеномным, морфологическим и акустическим дынным. Комплекс M. berdmorei включает четыре вида, при этом два из них – описаны в нашей ревизии: это M. sundaica и M. peninsularis. Исследование является первым опытом применения филогеномных методов в систематике азиатских бесхвостых амфибий. Результаты представлены в докладах на двух конференциях (Трофимец и др., 2024а, Trofimets et al., 2024a) и опубликованы в статье в журнале Vertebrate Zoology (Q1): Trofimets et al., 2024b. Впервые проведено исследование сравнительной филогеографии, генетической и морфологической изменчивости широкоарельных комплексов рода Microhyla: M. heymonsi, M. butleri, M. mukhlesuri-M.fissipes и M. pulchra. Молекулярно-генетический анализ включил 577 проб комплекса M. heymonsi из 193 локалитетов, 272 — M. butleri из 115 локалитетов, 151 — M. mukhlesuri-M.fissipes из 85 локалитетов и 59 — M. pulchra из 30 локалитетов. Морфометрия проведена для M. heymonsi (93 экз.), и для M. butleri (42 экз.). Показана дифференциация комплексов M. heymonsi и M. butleri по мтДНК и морфологическим признакам. Филогеномный анализ по данным ddRADseq для M. butleri подтверждает наличие двух клад видового ранга. Предварительные данные представлены в докладе на международной конференции (Трофимец и др., 2024б). Опубликованы новые находки, расширяющие ареал Micryletta hekouensis, этот вид впервые отмечен нами во Вьетнаме. Приводится расширенное описание этого вида. Статья опубликована в журнале Herpetozoa (Q2): Nguyen et al., 2024a. Впервые изучена изменчивость узкоротов комплекса Kaloula baleata; по данным анализа фрагмента 12S-16S мтДНК построено генеалогическое древо рода Kaloula, из Индокитая описано два новых вида – K. laosensis из Лаоса и K. discordia из южного Вьетнама, отличающийся от других видов окраской, комбинацией морфологических признаков, а также генетически. По нашим данным K. rigida, K. kalingensis, K. pulchra и K. baleata имеют высокое генетические разнообразие между разными популяциями, среди которых есть криптические виды. Результаты доложены на международной конференции (Горин, Поярков, 2024). Статья принята в печать в журнале Herpetozoa (Q2): Gorin et al., in press. Изучено разнообразие остеологических признаков подсемейства Microhylinae. Проведен анализ связи образа жизни и морфологии скелета в разных родах. Показано, что переход к определенному образу жизни у Microhylinae связан со специфической морфологией, а сходные морфологические адаптации независимо возникают в разных линиях. Результаты представлены в докладе на международной конференции (Gorin, Poyarkov, 2024). Впервые изучено разнообразие рода Vietnamophryne: получена филогения для этого рода, из центрального Вьетнама выявлен потенциальный новый вид. Анализ морфометрических данных показывает наличие устойчивых отличий во внешней морфологии и подтверждает обособленность данной популяции. Подготовлено описание нового вида, которое мы планируем опубликовать в 2025 г. Впервые опубликовано исследование криптических видов комплекса Hylarana milleti фауны Индокитая и южного Китая по генетическим (мтДНК) и морфологическим данным. Подтверждена самостоятельность вида Hylarana bannanica, распространение H. milleti ограничено южным Вьетнамом. Статья опубликована в журнале Herpetozoa (Q2): Liu et al., 2024. Опубликованы новые находки, расширяющие ареал Rhacophorus napoensis, вид впервые отмечен нами во Вьетнаме. Приводится расширенное описание этого вида по новым материалам. Полученные данные доказывают необходимость дальнейших исследований по систематике комплекса R. bipunctatus в Индокитае. Статья опубликована в журнале Herpetozoa (Q2): Nguyen et al., 2024b. Изучена филогеография домовых веслоногов рода Polypedates фауны Индокитая, проанализированы последовательности гена 16S рРНК для 567 экз. из 240 локалитетов, выявлен ряд ранее неизвестных линий в видовом комплексе P. leucomystax. Результаты представлены в докладе на международной конференции (Банин и др., 2024). Результаты по классу Reptilia Впервые проведен анализ разнообразия и филогенетических связей семейства Dibamidae в масштабе мировой фауны. По данным анализа 3х генов мтДНК и 6 генов яДНК впервые была получена наиболее полная филогения для семейства Dibamidae, включающая 54 экземпляра 18 видов рода Dibamus. Показана монофилия рода Dibamus. Получен новый биогеографический сценарий для семейства. Выявлены пять новых видов Dibamus. Проведен анализ признаков внешней морфологии и остеологии. Предварительные данные представлены в четырех докладах на международных конференциях (Клюкин и др., 2024а, 2024б, Kliukin et al., 2024a, 2024b). По интегративным данным подготовлены описания двух новых для науки видов рода Dibamus из Вьетнама (D. deimontis), и Камбоджи (D. elephantinus); они опубликованы в журналах Zootaxa (Q2): Kliukin et al., 2024c; и Зоологический Журнал (Q3): Клюкин и др., 2024в. Получены новые данные по систематике кривопалых гекконов рода Cyrtodactylus. Изучена генетическая и морфологическая изменчивость гекконов группы видов C. brevipalmatus; по данным анализа гена ND2 мтДНК построено генеалогическое древо, c острова Пхукет в Таиланде описан новый для науки вид C. thalang, исследована биогеографическая история этой группы видов, предполагающая ее возникновение на территории Малайского п-ова. Статья опубликована в журнале Zootaxa (Q2): Grismer et al., 2024. Изучена генетическая и морфологическая изменчивость гекконов из группы видов C. angularis; по данным анализа генов ND2 и COI мтДНК построено генеалогическое древо, из карстов района Фонгня-Кебанг во Вьетнаме описан новый для науки эндемичный вид C. hangvaensis. Статья опубликована в журнале Zootaxa (Q2): Duong et al., 2024. По данным анализа генов ND2 и COI мтДНК проанализировано разнообразие и историческая биогеография гекконов группы видов C. irregularis. Результаты представлены в докладе на международной конференции (Poyarkov, Bragin, 2024). Получены предварительные данные о молекулярной и морфологической дифференциации группы видов C. consobrinus фауны Малайского п-ова, выявлено 6 потенцильных новых видов. Результаты представлены в докладе на международной конференции (Quah et al., 2024). Проведено интегративное исследование биогеографии и разнообразия гекконов рода Cnemaspis фауны Южной Азии, предварительные результаты представлены в докладе на международной конференции (Gorin et al., 2024). По молекулярным данным изучена филогения и разнообразие геккончиков родов Alsophylax и Microgecko фауны Средней Азии и Ирана, выявлено несколько потенциально новых для науки видов; предварительные результаты представлены в двух докладах на международных конференциях (Шепеля и др., 2024; Nazarov et al., 2024a). По интегративным данным исследована систематика, филогения и биогеогарфия листопалых гекконов рода Asaccus; из южного Ирана описан новый для науки вид A. authenticus; cтатья опубликована в журнале Zootaxa (Q2): Nazarov et al., 2024b. Проведено интегративное исследование разнообразия и систематики агам рода Bronchocela фауны Индонезии. Результаты представлены в докладе на международной конференции (Amarasinghe et al., 2024). Исследовано разнообразие и систематика сцинков родов Ablepharus и Protoblepharus из Гималаев и Тибета; построено дерево по данным анализа мтДНК маркеров для 265 экземпляров, выявлено 10 потенциальных новых видов. Результаты представлены в докладе на международной конференции (Bragin et al., 2024a); статья принята в печать в журнале Russian Journal of Herpetology (Q2): Bragin et al., in press. Впервые проведено исследование филогении, разнообразия и исторической биогеографии сцинков родов Ablepharus и Protoblepharus с использованием молекулярно-генетического анализа. В анализ вошли 306 образцов, включая 20 номинальных видов по последовательностям 4 генов мтДНК и 3 генов яДНК. Результаты представлены в докладе на международной конференции (Bragin et al., 2024b). Изучена генетическая и морфологическая изменчивость миниатюрных сцинков фауны Вьетнама и Камбоджи; обнаружено морфологическое сходство представителей миниатюрных сцинков: Sphenomorphus sheai, S. tridigidus, Lygosoma veunsaiense и Leptoseps poilani; по данным анализа гена ND2 мтДНК построено генеалогическое древо рода Sphenomorphus. Из Южного Вьетнама описан новый для науки вид S. valentinae; cтатья принята в печать в журнале Current Studies in Herpetology: Bragin et al., in press. Впервые исследована филогения и разнообразие мелких сцинков родов Scincella и Sphenomorphus фауны ЮВА, по 5 генам мтДНК и 4 генам яДНК построено филогенетическое дерево, выявлена парафилия Sphenomorphus и Scincella, а также не менее 18 линий, потенциально представляющих собой новые для науки виды. Данные представлены в докладе на международной конференции (Зенин и др., 2024). Впервые изучено филогенетическое положение змей рода Colubroelaps. Из Вьетнама описан новый для науки второй вид этого рода – C. adleri, описание которого принято в печать в журнале Herpetozoa (Q2): Poyarkov et al., in press. Кроме того, впервые для всех известных представителей Colubroelaps проведен мультилокусный филогенетический анализ по 12 генам мтДНК и яДНК, показано, что Colubroelaps представляет собой сестринскую линию по отношению к Sibynophiidae и должен рассматриваться как самостоятельное семейство змей; работа по филогении этой группы готовится к печати. Изучена морфологическая и генетическая изменчивость змей группы Oligodon cinereus; на основании анализа генов мтДНК построено древо рода Oligodon. Из карстовых образований южного Таиланда описан новый для науки вид O. speleoserpens, который хорошо отличается от других видов рода по морфологическим и генетическим признакам; это первый известный науке пещерный вид рода. Статья опубликована в журнале Vertebrate Zoology (Q1): Pawangkhanant et al., 2024b. Впервые изучено разнообразие, филогенетические связи и разнообразие змей рода Oligodon в масштабе мировой фауны по мультилокусным данным. Oligodon это второй по величине род змей, в наш анализ вошли данные по 57 видам рода. Результаты предполагают возникновение Oligodon в ЮВА, выявлено не менее 10 потенциально новых видов. Результаты представлены в виде доклада на международной конференции (Lee et al., 2024a) и опубликованы в статье в журнале Molecular Phylogenetics and Evolution (Q1): Lee et al. (2024b). Проведено интегративное исследование разнообразия волкозубов группы видов Lycodon subcinctus, по молекулярным и морфологическим данным из Индокитая описан новый для науки вид L. neomaculatus; cтатья опубликована в журнале Zootaxa (Q2): Nguyen et al., 2024c. Исследована генетическая и морфологическая изменчивость куфий видового комплекса Trimeresurus kanburiensis; описан новый для науки вид T. kraensis из перешейка Кра. Открытие подчеркивает роль карстовых массивов как центров видообразования. Результаты представлены в виде двух докладов на международных конференциях (Idiiatullina et al., 2024a; Идиятуллина и др., 2024а) и опубликованы в журнале European Journal of Taxonomy (Q2): Idiiatullina et al., 2024b. Исследована генетическая и морфологическая изменчивость куфий подрода Popeia; уточнен диагноз и распространение T. popeiorum; описаны два новых вида – T. lanna и T. tenasserimensis. Наша публикация подчеркивает важность интегративного подхода при выделении новых видов куфий и роль Индо-Бирмы как центра биоразнообразия. Cтатья опубликована в журнале Vertebrate Zoology (Q1): Idiiatullina et al., 2024b. Получена филогения для видового комплекса T. macrops; описан новый вид T. cyanolabris из прибрежных районов Южного Вьетнама; cтатья опубликована в журнале Zootaxa (Q2): Idiiatullina et al., 2024d. Исследована генетическая изменчивость и филогеография куфий подрода Viridovipera; по данным мтДНК и яДНК построено наиболее полное филогенетическое древо подрода. Предложен биогеографический сценарий для подрода. Полученные результаты подчеркивают роль орогенетических событий в кладогенезе Viridovipera. Публикация готовится к печати. На основе морфологического и молекулярного анализа 35 экземпляров и дополнительных находок подтверждено присутствие T. caudornatus в северной Мьянме и соседних провинциях Китая; уточнен диагноз вида; статья опубликована в журнале Zootaxa (Q2): Nguyen et al. et al., 2024d. Получена филогения подсемейства Crotalinae по мультилокусным данным (25 генов); предложена новая гипотеза заселения Crotalinae Нового Света; обнаружена линия потенциально родового статуса; в пределах родов Protobothrops и Trimeresurus предложена новая таксономия. Результаты представлены в виде двух докладов на международных конференциях (Idiiatullina et al., 2024e; Идиятуллина и др., 2024б); публикация готовится к печати. Получены первые данные по филогеографии черепахи Indotestudo elongata, выявлено неожиданно низкое генетическое разнообразие этого широкоареального вида, выдвинута гипотеза о расселении черепахи человеком в историческое время. Статья опубликована в журнале Salamandra (Q2): Ihlow et al. et al., 2024. Практическая значимость Основная практическая значимость результатов, полученных нами в ходе выполнения проекта, заключается в получении принципиально новых данных о дифференциации земноводных и пресмыкающихся Евразии. Для многих из исследованных нами групп амфибий и рептилий наши результаты убедительно свидетельствуют о значительной недооценке действительного разнообразия, в ряде групп число признанных таксонов почти в два раза меньше чем число выявленных нами линий видового уровня дифференциации. В ходе выполнения нашего проекта мы пересмотрели имеющиеся представления о видовом богатстве фауны амфибий и рептилий Азии (прежде всего различных регионов Юго-Восточной Азии) и описали значительное число новых для науки таксонов позвоночных животных. Так за весь срок выполнения проекта опубликованы описания 34 новых для науки таксонов амфибий и рептилий, в том числе трех новых видов тритонов, одного нового вида жаб и шести новых видов лягушек, а также один новый род и 14 новых видов ящериц и девять новых для науки видов змей. Многие из открытых нами животных являются узкоареальными эндемиками, а некоторые, как например карстовая агама Laodracon carsticola (ранее неизвестный науке род и вид ящериц) из Лаоса или шнурковая змея Адлера Colubroelaps adleri из Вьетнама находятся под критической угрозой исчезновения. Помимо этого, впервые предпринята масштабная попытка инвентаризации разнообразия фауны земноводных и пресмыкающихся полуострова Индокитай, составлены уточненные аннотированные списки герпетофауны Вьетнама и Таиланда, впервые составлены аннотированные списки герпетофауны Камбоджи и Вьетнама. Полученные результаты имеют кардинальное значение для срочной разработки адекватных природоохранных мер для сохранения биоразнообразия амфибий и рептилий Юго-Восточной Азии. Наше исследование подтвердило ключевую роль тропических регионов Индокитая как глобального центра биоразнообразия амфибий и рептилий. При этом именно тропические леса Южной и Юго-Восточной Азии подвергаются наиболее масштабным угрозам со стороны антропогенных факторов из всех прочих регионов мира (Sodhi et al., 2004). Оценка и разработка мер охраны биоразнообразия этого региона является одним из важнейших вызовов, стоящих перед научным и природоохранным сообществом. При этом, как показал наш анализ, природоохранный статус значительной части видов амфибий и большей части видов рептилий Индокитая остается неопределенным, что делает проводимые в странах тропической Азии исследования особенно актуальными. Исследование и сохранение глобального биоразнообразия – одна из важнейших задач, стоящих перед человечеством в XXI веке. Учитывая исторически значительный вклад отечественной герпетологии в изучение герпетофауны Евразийского континента, степень квалификации и имеющийся научный задел российских специалистов создают неоспоримое преимущество в этой области зоологических исследований. В связи с этим, очень важно, что бы российские специалисты продолжали занимать лидирующие позиции не только в конкретных таксономических исследованиях, но и в обобщающих ревизиях, в работах инвентаризирующих разнообразие фауны и анализирующих пути ее формирования и перспективы ее сохранения. Особенное значение здесь имеет интенсификация исследований в глобальных центрах биологического разнообразия, то есть, прежде всего, в тропических регионах. Существенную роль для будущих работ также играет и разработка автоматизированных алгоритмов определения видового статуса линий по данным ДНК-баркодинга и мультилокусного филогенетического анализа, а также переход на инновационные технологии высокопроизводительного секвенирования, с каждым годом становящиеся все более доступными (Dufresnes et al., 2023, 2024). Опубликованные нами работы привлекли значительное внимание международных научных коллективов, в результате сотрудники нашего научного коллектива активно сотрудничают с группами по сохранению земноводных и пресмыкающихся IUCN (Международного союза охраны природы). Таким образом, широкий масштаб осуществленных нами исследований поспособствовал закреплению авторитета отечественной герпетологии в области исследований и сохранения герпетофауны Азии и теоретических вопросов исследования биологического разнообразия в целом. |
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".