RSF-INSF: Выяснение механизмов патологической трансформации амилоидогенных белков: поиск профилактических подходов.НИР

Unraveling the Mechanisms of Pathological Transformation in Amyloidogenic Proteins: A Quest for Preventative Approaches.

Соисполнители НИР

IBB UT Соисполнитель

Источник финансирования НИР

грант РНФ

Этапы НИР

# Сроки Название
1 1 февраля 2024 г.-31 декабря 2024 г. RSF-INSF: Выяснение механизмов патологической трансформации амилоидогенных белков: поиск профилактических подходов.
Результаты этапа: Целью совместного с Тегеранским университетом проекта является выяснение новых механизмов возникновения и развития нейродегенеративных заболеваний амилоидной природы, а именно болезней Альцгеймера и Паркинсона, а также прионных патологий. Кроме того, при реализации проекта предполагается найти подходы к предотвращению патологической трансформации амилоидогенных белков, прежде всего с помощью альфаВ-кристаллина, обладающего шапероно-подобными функциями. Для достижения поставленных целей на первой стадии выполнения проекта обеими группами участников были разработаны оригинальные способы получения необходимых белков, а именно, альфаВ-кристаллина, альфа-синуклеина, бета-амилоидного пептида 1-42, тау-белка и прионного белка. Кроме того, иранскими партнерами было получено 6 мутантных форм альфаВ-кристаллина, а российскими мутантная форма альфа-синуклеина А53Т без каких-либо дополнительных мотивов в его структуре. Был также проведен обмен полученными белками и плазмидами, необходимыми для их получения, между российскими и иранскими участниками проекта. Выделенные белки и их мутантные формы были охарактеризованы с помощью различных физико-химических методов, что позволило продемонстрировать сохранение ими структурных особенностей и функциональной активности, а также выявить последствия введения мутаций, как в альфа-синуклеин, так и в альфаВ-кристалаллин. Иранскими партнерами были получены данные о влиянии введения мутаций в альфаB-кристаллин на его свойства. В частности, на изменения параметров собственной флуоресценции и оптических характеристик, а также термодинамических параметров методом дифференциальной сканирующей калориметрии. Обнаружено, что введение мутаций существенно изменяет конформацию альфаВ-кристаллина, хотя и не препятствует формированию его олигомерных форм, характерных для белка дикого типа. Последнее наблюдение было подтверждено российскими партнерами с помощью метода динамического рассеяния света. Высказано предположение, что сохранившие олигомерное состояние мутантные формы альфа-кристаллина будут эффективно подавлять патологическую трансформацию амилоидогенных белков. Российскими партнерами было выявлено взаимодействие между двумя белками - актином и глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназой, принимающими участие в развитии нейродегенеративных заболеваний, в частности болезни Альцгеймера. Было обнаружено, что при связывании S-нитрозилированной глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы с актином протекает реакция транснитрозилирования, приводящая к переносу NO-группы от фермента на С-концевой остаток цистеина Cys374 актина. Имеющаяся информация о роли актина в развитии нейродегенеративных патологий показывает, что актин и его комплексы с глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназой могут быть новыми мишенями при разработке лекарственных средств против амилоидных заболеваний. Для выяснения особенностей взаимодействия прионного белка PrP с белками-партнерами, а также роли отдельных участков этого белка в формировании амилоидных структур были выделены и охарактеризованы N- и С-концевых фрагменты PrP. Выделенный структурированный С-концевой фрагмент прионного белка в целом сохранял вторичную структуру, характерную для полноразмерного PrP, и обладал способностью формировать амилоидные структуры. При этом размер амилоидных агрегатов был существенно меньше, чем размер фибрилл, образованных полноразмерным PrP. Неструктурированный N-концевой фрагмент PrP не только не формировал амилоидных агрегатов, а, напротив, препятствовал фибриллизации полноразмерного PrP. Разное воздействие N-концевой фрагмент PrP оказывал на патологическую трансформацию других амилоидных белков. Так, амилоидная трансформация бета-амилоидного пептида 1-42 предотвращалась N-концевым фрагментом PrP. Однако, в отличие от воздействия на бета-амилоидный пептид, N-концевой фрагмент PrP стимулировал амилоидную трансформацию альфа-синуклеина дикого типа и его мутантной формы А53Т. В обоих случаях в присутствии N-концевого фрагмента PrP существенно уменьшалась лаг-фаза появления амилоидных структур. Таким образом, было показано, что два фрагмента PrP могут оказывать влияние как на агрегацию исходного полноразмерного PrP, так и на трансформацию других амилоидогенных белков, причем характер воздействия зависит от свойств конкретного белка. Возможно, N-концевой фрагмент PrP может быть использован для предотвращения патологической трансформации бета-амилоидных пептидов и самого прионного белка. С целью выяснения возможной взаимосвязи коронавирусной инфекции, а также вакцинации против этого заболевания, и развития нейродегенеративных болезней, в частности болезни Паркинсона, было изучено взаимодействие вирусных белков и альфа-синуклеина. Для этого был выделен и охарактеризован RBD-фрагмент спайк-белка коронавируса SARS-CoV-2, экспрессированный в эукариотической системе. Было продемонстрировано взаимодействие RBD-фрагмента спайк-белка и N-белка SARS-CoV-2 с альфа-синуклеином с помощью иммуноферментного анализа. Было показано также, что RBD-фрагмент спайк-белка может предотвращать амилоидную трансформацию мутантной формы альфа-синуклеина А53Т, увеличивая лаг-фазу фибриллизации и снижая выход амилоидных форм. При этом N-белок, напротив, значительно стимулировал амилоидоизацию альфа-синуклеина А53Т. Сделанные наблюдения указывают на то, что возникновение нейродегенеративных процессов амилоидной природы более вероятны при вакцинации против SARS-CoV-2 препаратами, содержащими N-белок. Для дальнейшего анализа описанных процессов были получены клеточные линии нейробластомы SH-SY5Y, стабильно экспрессирующих человеческий альфа-синуклеин дикого типа, а также мутантную форму альфа-синуклеина А53Т (3 клона), которые будут использованы для одновременной экспрессии в клетках альфа-синуклеина и белков коронавируса. Участниками проекта было проведено 2 совместных семинара (один виртуальный и один очный) и организован визит руководителя иранского проекта профессора Резы Юсефи в Москву. Российская лаборатория участвовала в акции РНФ «День без турникетов». По результатам проведенной работы было опубликовано 2 статьи - одна экспериментальная и одна обзорная в журнале первого квартиля (обе в журнале «Archives of Biochemistry and Biophysics», из-во «Elsevier»). Одна обзорная статья принята в печать в отечественный журнал «Успехи биологической химии» («Biochemistry» (Moscow)) второго квартиля и будет опубликована в феврале 2025 года. Готовятся к публикации несколько совместных с иранскими коллегами статей. Результаты работы были представлены на двух конференциях («Биохимия человека 2024» и «VI Международная конференция Постгеном'2024. XI Российский симпозиум Белки и пептиды. Российско-Китайский конгресс») в виде 3 устных докладов.

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".