|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ФИЦ ПХФ и МХ РАН |
||
Reverse Mapping Algorithm for Multi-scale Numerical Simulation of Polylactic Acidстатья Электронная публикация Исследовательская статья Краткое сообщение
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Информация о цитировании статьи получена из
Scopus
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 10 апреля 2019 г.
- Авторы: Glagolev Mikhail K., Vasilevskaya Valentina V.
- Журнал: Supercomputing Frontiers and Innovations
- Том: 5
- Номер: 3
- Год издания: 2018
- Первая страница: 103
- Последняя страница: 106
- DOI: 10.14529/jsfi180319
- Аннотация: An algorithm is proposed to convert the coarse-grained A-graft-B model of polylactic acid into the atomistic representation. In the A-graft-B model the atoms of the backbone are mapped onto A beads, which form the linear backbone of the coarse-grained macromolecule, the methyl groups are mapped onto B side pendants.The algorithm restores atomic positions based on positions of coarse-grained beads with the help of pre-defined chain fragments, called templates. The dimensions of the templates are adjusted by affine transformation to ensure coincidence of the backbone in coarse-grained and atomistic representation. The transition between coarse-grained and atomistic models conserves information about the fine structure of polymer chains. The restored configurations are suitable for further molecular-dynamic simulations. Both atomistic and coarse-grained representations require standard GROMACS software. The algorithm can be used for reverse mapping of other A-graft-B polymer models.
- Добавил в систему: Глаголев Михаил Константинович
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|