Роль длинных некодирующих РНК CCAT1 и SNHG14 в активацииряда белок-кодирующих генов, связанных с развитием рака яичниковстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 20 апреля 2022 г.
Аннотация:Поздняя диагностика рака яичников представляет одну из важнейших проблем в его лечении. Длинные некодирующие РНК (днРНК) мало изучены, но перспективны в качестве диагностических биомаркеров. Изучали интерактом днРНК для выявления биомаркеров с потенциальной значимостью для молекулярной диагностики рака яичников. С помощью скрининга базы данных TCGA выявили дифференциально экспрессируемые днРНК CCAT1 и SNHG14. На основании показателей комплементарности CCAT1 и SNHG14 последовательностям мРНК были выбраны 5 белок-кодирующих генов: MAPK1, с-MET, TGFB2, SNAIL1, WNT4, которые связаны с эпителиально-мезенхимальным переходом. Методом ПЦР в реальном времени в 54 образцах рака яичника подтверждена высокая экспрессия CCAT1 и SNHG14 (logFC>1.5, p<0.05). Установлена положительная корреляция между уровнями экспрессии двух днРНК и мРНК пяти генов эпителиально-мезенхимального перехода в шести парах. Активирующее влияние CCAT1 и SNHG14 на экспрессию этих генов может реализовываться при посредничестве miR-203 и miR-124.Ключевые слова: рак яичников; длинные некодирующие РНК; микроРНК; эпителиально-мезенхимальный переход; биомаркеры