Аннотация:В последние годы, активное применение молекулярных методов в биологии привело к буквально взрывному увеличению случаев выявления новых таксонов, в том числе и среди голожаберных моллюсков (Mollusca: Doridida и Nudibranchia). В систематике появились новые понятия (такие, как “криптический вид”) и развиваются новые подходы (филогеография). С другой стороны, в мировой науке наблюдается явный перекос в сторону приоритета результатов молекулярно-филогенетических исследований над данными, выявляемыми классическими морфологическими методами и данными онтогенетических исследований. Все это потребовало поиска прогрессивных подходов и методов, позволяющих обработать огромный поток новой информации. Для этого центральная роль онтогенеза в широком смысле (который охватывает все основные свойства организма, а также генетические и эпигенетические процессы) выдвигается на первый план для будущего развития таксономии и филогенетики. Предлагаемые подходы Многоуровневое разнообразие организмов и Онтогенетическая систематика являются не только развитием важных теоретических обобщений, дающих возможность осуществить ре-синтез онтогенеза, эволюции и таксономии, а также по-новому подойти к «проблеме вида», но и служат успешными практическими методами. Например, впервые последовательно сформулированный подход по построению Филопериодических Таблиц, объединяющий филотипические периоды онтогенеза и молекулярную филогенетику, продемонстрировал практические примеры построения прогностических филопериодических таблиц на уровне от отряда до вида. Благодаря такому подходу были распознаны тонкомасшатабные морфологические отличия между генетически отчетливо обособленными видами моллюсков из родов Polycera (P. capitata и P. quadrilineata), а также шесть новых видов в роде Cadlina. С помощью онтогенетических, таксономических, а также с помощью нескольких независимых молекулярно- филогенетических исследований, обобщенных в форме Филопериодического подхода, доказательно продемонстрировано, что в ходе формирования отряда голожаберных моллюсков дорид (Doridida), исходная боковая жабра плеуробранхид переместилась на спинную сторону с образованием особой жаберной полости и жаберного кольца. Последующая многократная независимая редукция жаберной полости у фанеробранхиальных дорид, а не ее первичное редуцированное состояние (как ранее ошибочно полагали), подтверждена благодаря открытию уникальных реликтовых таксонов Onchimira Martynov et al., 2009 и Elfdaliana Martynov & Korshunova, 2015, сохранивших настоящую жаберную полость (криптобранхиальное состояние), при одновременном наличии эволюционно продвинутых признаков радулярного аппарата, характерного для преимущественно фанеробранхиальных таксонов семейств Onchidorididae и Polyceridae (т.е. у представителей этих семейств исходная жаберная полость целиком редуцировалась). Исследования моллюсков отрядов Doridida и Nudibranchia, доказательно продемонстрировали, что разделение биологического разнообразия на «криптическое» и «не криптическое» контрпродуктивно, поэтому предлагается последовательно отказаться от понятия «криптический вид». Вместо этого предлагается универсально обозначить центральное биологическое явление вида, как Многоуровневое разнообразие организмов, что одновременно предоставляет обновленный практический набор методов, отвечающий требованиям современной биологической науки. Работа выполнена в рамках госзаданий No. 0088-2024-0011(ИБР РАН) и 18-1-21 №121032300105-0 (Зоологический музей МГУ).